孔雀鱼品种多样、色彩绚丽、体态娇小、游动灵活、易于饲养，因而深受大众喜爱。孔雀鱼区分公母其实很简单，其中一个最显著特征，是公鱼要比母鱼艳丽。
公鱼不仅色彩绚丽，而且鱼鳍偏长，体型健硕，游动活泼快速，喜欢追逐母鱼。而母鱼相对来说体型较大，肚腹肥硕，色彩略逊，动作略显笨拙，常被公鱼追逐。
从侧面看鱼腹部的腹鳍，公鱼和母鱼有明显区别:公鱼腹鳍呈棍棒状，在公鱼靠近母鱼身体时，其腹鳍会朝向母鱼腹鳍处，意欲实现交配，而母鱼腹鳍呈圆弧三角状。上述这些公鱼和母鱼的区别，是在孔雀鱼从幼鱼长到成鱼的过程中逐渐显露出来的，在幼鱼期是无法识别的。
当长到成鱼是，可以一眼就可以看出来了。公鱼的颜色比母鱼的颜色要鲜艳，公鱼的鳍比较大，有花纹且颜色漂亮，母鱼的鳍短小，也没有绚丽的花纹。公鱼的臀鳍比较窄但细长，而母鱼的比较宽且呈扇形，公鱼腹部较小且瘦长。
